تضمّ مؤسّسة الهادي أربع مكتبات متخصّصة: المكتبة المدرسيّة، المكتبة الصّوتيّة، المكتبة الرّقميّة، ومكتبة البرايل، ويتمّ تحديثها دوريًّا دعمًا للعمليّة التّعليميّة والمنهاج التّربويّ ولتوفير الثّقافة العامّة للطّلّاب والخرّيجين، كحقّ من حقوق ذوي الإعاقة، وتنمية معارف التّلاميذ وخيالهم، إضافة إلى توفير مراجع للهيئة التّعليميّة.

- المكتبة المدرسيّة: تضمّ أكثر من 7000 وعاء معلوماتيّ مُمَكنن، ونحو 200 قرص CD تعليميّ وتربويّ وترفيهيّ، بالإضافة إلى وسائل تدعم العمليّة التّعليميّة.

 

- المكتبة الرّقميّة: تحتوي كتباً رقميّة متنوّعة مُتاحة عبر منصّة الهادي الالكترونية، للطلّاب والموظّفين.

- مكتبة البرايل: تضمّ مجموعة متخصّصة من الكتب المطبوعة حصريًّا بطريقة برايل لدعم التّلامذة من ذوي الإعاقة البصريّة.

- المكتبة الصّوتيّة: أُنشئت كمشروع عام 2006–2007، وأُتيحت خدماتها لتلاميذ المؤسّسة من المكفوفين وضعاف البصر، وتمّ توزيع محتوياتها على المكتبات اللّبنانيّة بالتّعاون مع وزارة الثّقافة اللّبنانيّة ضمن مشروع بيروت عاصمة عالميّة للكتاب.